BEBAM, Türkiye ve KKTC genelinde önde gelen üniversiteler, araştırma merkezleri ve sağlık kuruluşları ile ortak araştırma, klinik işbirlikleri ve akademik etkinlikler yürütmektedir.

Başlıca ulusal işbirliği paydaşları:

• Yakın Doğu Üniversitesi Hastanesi
• Yakın Doğu Üniversitesi Tıp Fakültesi
• YDÜ Kalite ve Akreditasyon Birimi
• Kıbrıs Uyku Araştırmaları Derneği

Bu iş birlikleri kapsamında çok merkezli araştırmalar, ortak projeler, klinik veri temelli çalışmalar ve ortak bilimsel etkinlikler yürütülmektedir.